Хромосомын хэлбэрийг тогтоох (3C)-д суурилсан аргууд хроматин дагуух хос цэгүүдийн биет ойр байдлыг тодорхойлох замаар цөм доторх хромосомын зохион байгуулалтыг илрүүлдэг. Тэд хроматин харилцан үйлчлэлийг хөндлөн холбоос, дараа нь харилцан үйлчилж буй бүс нутгийг задлах, холбох, дараалалд оруулах замаар хадгалдаг.
Хромосомын хэлбэржилт хэрхэн ажилладаг вэ?
Хромосомын бүтцийг чип дээр барих (4C) нэг локус болон бусад бүх геномын локус хоорондын харилцан үйлчлэлийг тогтооно. Энэ нь урвуу ПГУ-ыг хийхэд ашигладаг өөрөө дугуйлсан ДНХ-ийн хэлтэрхий үүсгэх хоёр дахь үе шатыг холбодог. … Нэг бичил массив дээр ойролцоогоор сая харилцан үйлчлэлд дүн шинжилгээ хийх боломжтой.
Хроматин конформацийн зураг авалт гэж юу вэ?
Хроматин конформацийг авах (3C) нь хроматин бүтцийг судлахад ашигладаг чухал арга, түүнчлэн бусад хэд хэдэн дериватив аргуудын үндэс суурь юм. … Протокол нь эсийг формальдегидийн хөндлөн холбоосоор холбож, дараа нь хроматиныг тусгаарлаж, хязгаарлах ферментийн тусламжтайгаар задалдаг.
Hi-C дараалал хэрхэн ажилладаг вэ?
Hi-C арга нь хроматин контактуудыг геномын хэмжээнд зураглахын тулд 3C-Seq-г өргөтгөдөг, мөн үүнийг in situ хроматин харилцан үйлчлэлийг судлахад ашигласан. Энэ аргын хувьд ДНХ-уургийн цогцолборыг формальдегидтэй холбодог. Дээжийг хэсэгчлэн хувааж, ДНХ-г ялган авч, холбож, хязгаарлах ферментийн тусламжтайгаар задалдаг.
Hi-C техник гэж юу вэ?
Сонгодог Hi-C арга нь формальдегидийн хөндлөн холбоос бүхий геномын тусгай хязгаарлалтын ферментүүдтэйзадралыг хязгаарлаж, дараа нь шингэсэн төгсгөлийг дүүргэж, засварлахыг агуулдаг. биотинтэй холбоотой нуклеотидууд. Дараа нь зассан үзүүрүүдийг дахин холбодог.
