Молекул биологийн шинжлэх ухаанд STRING (Харилцаж буй ген/уураг хайх хэрэгсэл) нь уураг-уургийн харилцан үйлчлэлийн мэдэгдэж байгаа болон урьдчилан таамагласан биологийн мэдээллийн сан, вэб нөөц юм. … Хамгийн сүүлийн хувилбар 11b нь 5000 гаруй организмын 24,5 сая уургийн мэдээллийг агуулсан.
STRING мэдээллийн сангийн зорилго юу вэ?
STRING мэдээллийн сан нь олон тооны организмын мэдэгдэж байгаа болон урьдчилан таамагласан уураг – уургийн холбооны өгөгдлийг нэгтгэх замаар энэ мэдээллийг цуглуулж, нэгтгэх зорилготой.
STRING оноо гэж юу вэ?
STRING-д уураг-уургийн харилцан үйлчлэл бүрийг нэг буюу хэд хэдэн "оноо"-оор тэмдэглэнэ. Хамгийн чухал нь эдгээр оноо нь харилцан үйлчлэлийн хүч чадал, өвөрмөц байдлыг илэрхийлдэггүй. Үүний оронд тэдгээр нь итгэлийн үзүүлэлт, өөрөөр хэлбэл STRING нь харилцан үйлчлэлийг үнэн гэж хэр магадлалтай гэж дүгнэдэг байгаа нотлох баримтуудыг харгалзан үздэг.
Уургууд яагаад харилцан үйлчилдэг вэ?
Уураг-уургийн харилцан үйлчлэл (PPI) нь цахилгаан статик хүч, устөрөгч зэрэг харилцан үйлчлэлээр удирдуулсан биохимийн үйл явдлын үр дүнд хоёр буюу түүнээс дээш уургийн молекулуудын хооронд тогтсон өндөр өвөрмөц физикийн контактууд юм холболт ба гидрофобик нөлөө.
Функциональ холбоо гэж юу вэ?
тодорхойлолт. Биологийн биетүүдийн хоорондох хоёртын хамаарал тэдгээрийн аль нэг нь нөгөөгийнхөө үйл ажиллагаа, илэрхийлэл, доройтол, тогтвортой байдлын хувьд нөгөөг нь хувиргах, харилцан хамааралТүншүүдийн хоорондын харилцааг шууд тодорхойлох боломжгүй тул завсрын үе шатууд нь далд хэлбэрээр байдаг.